Родился 11 апреля 1978 года в семье протоиерея Геннадия Нефёдова (1942−2017). Крещён в честь преподобного Иоанна Лествичника (день памяти 12 апреля).

В 1999 г. закончил Московскую регентско-певческую семинарию, в том же году поступил в Московскую духовную семинарию, которую окончил в 2009 г.

С 2000 по 2008 г. был иподиаконом Святейшего Патриарха Алексия II и регентом хора духовенства.

2 декабря 2004 г. Святейшим Патриархом Алексием II Кафедральном соборном Храме Христа Спасителя рукоположен в сан диакона.

В 2008 г. стал иподиаконом Патриаршего Местоблюстителя митрополита Кирилла, а с 1 февраля 2009 г. иподиаконом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Кирилла.

В 2009 г. назначен на должность заведующего отделом богослужебных книг Издательства Московской Патриархии, где продолжает трудиться до настоящего времени.

2 декабря 2010 г. рукоположен Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом в сан священника с возложением набедренника.

25 января 2011 г. назначен штатным священником в Кафедральный соборный Храм Христа Спасителя.

В 2014 г. включен в состав Комиссии по составлению месяцеслова Русской Православной Церкви.

В 2015 г. прошел курсы повышения квалификации в Центре образования духовенства города  Москвы при Московской духовной академии.

В 2016 г. вошел в состав Рабочей группы по кодификации акафистов и выработке норм акафистного творчества Издательского Совета Русской Православной Церкви.

С 1 мая 2020 г. назначен настоятелем храма Спаса Преображения — Патриаршего подворья в Переделкине города Москвы.

20 ноября 2020 г. решением Святейшего Патриарха и Священного Синода включен в состав Комиссии Межсоборного Присутствия по богослужению и церковному искусству (с включением в состав Межсоборного Присутствия Русской Православной Церкви).

10 февраля 2022 г. назначен на должность ответственного священника-наставника по богослужебной подготовке ставленников (кандидатов на рукоположение в священный сан) в Западном викариатстве.

24 августа 2023 г. решением Святейшего Патриарха и Священного Синода включен в состав Синодальной богослужебной комиссии.

Женат. Имеет восьмерых детей.

Имеет церковные награды:
С 2013 г. удостоен права ношения камилавки.
С 2016 г. удостоен права ношения наперсного креста.
С 2021 г. удостоен права ношения палицы.

Орден благоверного. князя Даниила Московского. III степени  (2007 г.).